《御界神纪》围绕着最具中国特色的古典神话展开，黄帝与炎帝的战争将其他的人牵扯了进来，为了能够一同对抗强大的北欧一族，神话大陆又出现了新的势力。
炎黄，这是一个有著并列却又相对的矛盾之词。那是个由四人一起统治的混沌世界，这四人分别为：盘古、女娲、炎帝、黄帝。盘古对这个世界建立了天与地；女娲创造了人类；炎帝教导人类如何种植草药并传授草药学；统御人类并带领人类进化的任务则交由黄帝负责。但黄帝心中其实不满自己与另外三位并列，尤其是自己常与炎帝齐名这事，他是最无法容忍的。黄帝一直认为这个世界只要一个统治者就足够，但自己的实力还不足，因此他一直隐忍不发，直到他培育了一支专属自己的军队后，他便起兵挑战炎帝。
由於盘古、女娲都认定黄帝的起义只是一种小规模的抗争，也就没有放在心上，更何况彼此都还有更重要的任务而先行离去， 所以只留下个性仁慈的炎帝来面对，而炎帝也不是真的想要与黄帝发动战争，只是她希望可以利用她所了解的草药学，来帮助更多在这场战争中受伤的人民，因为她也了解，这次战役不是单方面想要中止就可以中止的了。另一个原因是，炎帝其实并没有强烈想要战争的意志，但炎帝的部下蚩尤却一直鼓吹著其他的部下要与黄帝对抗，而炎帝也没有利用强硬的手段去阻止，就因为这个缘故而展开了前哨战，虽然双方在最后的战况是平分秋色，两边的阵营此时也感觉到自己的实力不足，便开始进行找寻人才的行动。
炎黄的争战越显激烈，却有个阴谋笼罩著他们,,那个阴谋是北欧一族入侵他们,北欧一族顺便要中原失去原来的信仰.盘古的一句话,顿时让黄帝大吃一惊,神话大陆的监视者为了平衡这些神话,不得不出面协助黄帝等人摆平北欧一族。
无需担心配置问题。
虽然说剧情上是中国神话的剧情，但是游戏的人设确实标准的日系游戏风格，基本与第一代的人设区别不大，玩法也没有太大的改变。
每个人物在对战时都有不同的分工，大部分辅助的技能都可以为玩家提供非常不错的BUFF，在战斗中非常有用处。
